Sinopsi

La història té lloc entre el 16 i el 24 de desembre, un mes després del festival cultural. Amb les vacances d'hivern a la vista, la Brigada SOS, liderada per Haruhi Suzumiya, planeja fer una festa de nabe per Nadal. Tanmateix, el 18 de desembre, en Kyon arriba a l'escola i descobreix que tot ha canviat. Haruhi i Itsuki Koizumi han desaparegut, Yuki Nagato és una estudiant normal amb emocions, Ryoko Asakura, que havia estat eliminada per Yuki, també és una estudiant normal, i Mikuru Asahina no el reconeix. L'única pista que té és un marcapàgines deixat per la Yuki, que porta en Kyon en un viatge a través del temps vinculat a la història de l'episodi «Rapsòdia d'una fulla de bambú», mentre intenta resoldre el misteri i restaurar la seva línia temporal.